Au premier rang des affections rencontrées par les conducteurs de bus, figurent les atteintes au dos et aux épaules. Pour cela, il est conseillé de vérifier et adapter son siège à chaque prise de fonction. le conducteur pourra également à se lever et effectuer quelques mouvements de gymnastique entre chaque rotation. La pratique d'une activité physique régulière peut être d'une aide précieuse pour prévenir les lombalgies et autres TMS de l'épaule.

La profession de conducteur de bus fait également partie des professions particulièrement exposées au stress en raison des contraintes horaires, des contacts avec le public qui peuvent être difficiles, des risques d'agressions verbales et physiques. Il est conseillé aux conducteurs qui souffrent de ces conditions d'en parler à leur médecin du travail ou au CHSCT. Des stages de gestion du stress peuvent être proposés afin d'apprendre à gérer ces situations.